Es donava per fet que la seu del Museu del Còmic estaria ubicada a L’Hospitalet de Llobregat, tal i com va assegurar el conseller de Cultura de la Generalitat, Joan Manuel Tresserras, durant la inauguració del Saló del Manga 2008. “L’Hospitalet de Llobregat és la primera opció per acollir el Museu Nacional del Còmic”, va dir durant una visita institucional al Centre Cultural Tecla Sala i la Biblioteca Centre de L’Hospitalet acompanyat de l’alcaldessa Núria Marín, tot i que trigaria degut “a la conjuntura econòmica”. Tresserras va afegir aleshores que “és important que apostes de país es facin a ciutats com L’Hospitalet. L’entorn metropolità ha d’acollir enclaus culturals de referència” i “a més, L’Hospitalet és la segona ciutat de Catalunya i a això s’ha de notar”.

   Doncs bé, el cas és que el Museu del Còmic i la Il·lustració finalment s’ubicarà a l’entorn metropolità de Barcelona, però justament a l’altra banda, a Badalona, concretament a l’edifici de la Companyia Auxiliar de Comerç i la Indústria (CACI), a la façana marítima.

    Les raons per haver escollit aquest edifici d’estètica modernista, que disposa d’una superfície útil de més de 4.000 metres quadrats, per sobre de L’Hospitalet de Llobregat, Sitges i Sant Feliu de Llobregat són que el lloc és el que millor s’adequa a les necessitats del projecte, la bona comunicació en tren i en metro (estació Gorg de la línia 4 i futura línia 9) així com també el que visquin a Badalona il·lustradors i dibuixants com Jaume Passarell, Tomàs Marco i Enric Sió, segons la comissió de treball del Pla Director del Museu del Còmic i la Il·lustració de Catalunya formada pel Departament de Cultura i Mitjans de Comunicació, FICOMIC, l’Associació Professional d’Il·lustradors de Catalunya i col·leccionistes i experts del sector.

    El Museu neix, segons el Departament de Cultura i Mitjans de Comunicació, amb vocació de ser un centre de referència internacional del còmic i l’il·lustració catalanes, des del segle XIX fins avui en dia, i preservar, conservar i difondre el seu llegat, alhora que també ha d'esdevenir un espai per als creadors i el sector.